Les 18 vitraux réalisés par Arnaut de Moles entre 1500 et 1513 sont sûrement les plus beaux de la Renaissance parvenus jusqu'à notre époque.

Trois de ces verrières représentent les grands thèmes de l'ancien et du nouveau testament : la création du monde, la Crucifixion et enfin la Résurrection.
Les autres vitraux présentent des scènes diverses, suivant un même principe de réalisation :
- dans la partie supérieure, des anges et autres chérubins pour la Cour Céleste
- au centre (lancettes), des personnages de la bible (trois ou quatre selon le type de vitrail)
- enfin, en bas (prédelles), une petite scène de la vie du Christ ou d'un des personnages des lancettes.

Arnaut de Moles était originaire de Saint-Sever, un village des Landes.
La composition des vitraux est remarquable, avec notamment l'utilisation de la perspective (les personnages sont placés dans un décor avec un arrière plan constitué de paysages de plus en plus réduits).

Les autres vitraux de la cathédrale d'Auch furent placés après 1620. Les carreaux peints ont laissés la place à des verres blancs, plus lumineux.